Ang mga allergy sa tsokolate ay posible kahit na sila bihira. Ang hindi pangkaraniwang kababalaghan sa kasong ito ay nagmula sa mga protina ng kakaw. Ang taong alerdyik na kumonsumo nito pagkatapos ay nakakaranas ng kahirapan sa paghinga, may sakit sa ulo, rashes, tachychardia, pangangati at isang nasusunog na pang-amoy sa tiyan.

Ang mga sintomas na ito ay maaari ding obserbahan sa mga taong alerdye sa mga elemento na bumubuo ng tsokolate (mani, protina ng gatas, atbp..), kahit na sila ay hindi talaga alerhiya sa cocoa per se.