Sa maliliit na bata, sa kaganapan ng hormonal abnormality, ang paggamot ay maaaring binubuo ng mga iniksyon ng Testosterone, ang dosis at pagiging regular nito ay itinakda ng endocrinologist. Ang mahusay na sinusunod na paggamot na ito ay nagpapataas ng laki ng ari. Kapag ang micropenis ay sanhi ng mga tisyu ng ari ng lalaki na hindi sensitibo sa testosterone, ang hormonal na paggamot na ito ay walang epekto.

Kung mas maagang natukoy ang micropenis, mas mabilis na inilalagay ang paggamot, mas magiging epektibo ito. Maaaring kailanganin din ang paggamot sa panahon ng pagdadalaga. Pagkatapos ng pagdadalaga, ang hormonal na paggamot ay hindi na epektibo dahil ang mga tisyu ay hindi na tumutugon sa parehong paraan.

Kirurhiko paggamot ng micropenis     

Sa pagtanda, kapag ang micropenis ay hindi pa ginagamot o kapag ang paggamot ay hindi sapat na epektibo, ang pagtitistis ay posible. Gayunpaman, hindi ito palaging nagpapakita ng nakakumbinsi na mga resulta.

Ang seksyon ng ligament suspensaryo ng ari ng lalaki, na napupunta mula sa ari hanggang sa pubis, ay maaaring ihandog. Hindi nito binabago ang ari ng lalaki sa anumang paraan ngunit bahagyang tinatanggal ito sa pubis, na ginagawa itong mas mahaba. Ang nakuha na naobserbahan ay 1 hanggang 2 cm sa flaccid na estado at 1,7 cm sa pagtayo. Ang pagpapahaba na ito ay nakuha sa halaga ng isang hindi matatag na erect na ari, dahil ito ay hindi gaanong nakakabit sa pubis, na maaaring gawing mas madali ang pagtagos.

ANGautologous fat injection nagsasangkot ng pag-iniksyon ng taba ng paksa sa ilalim ng balat ng kanyang ari. Hindi nito pinahaba ang ari ng lalaki sa anumang paraan, ngunit nakikita itong mas makapal. Ang bahagi lamang ng taba na inilagay sa lugar ay hindi nasisipsip ng katawan sa paglipas ng panahon (10 hanggang 50% depende sa paksa). Ang resorption ay maaaring hindi pantay at humantong sa isang "rosaryo" na hitsura ng titi.

Ang micropenis ay maaaring magkaroon ng makabuluhang sikolohikal na epekto, lalo na sa panahon ng pagdadalaga, mahalaga na ang tao ay matulungan at ang kanyang mga pagdududa ay isinasaalang-alang.