Ang mga impeksyon sa fungal ay kadalasang nagmumula sa isang simpleng kawalan ng timbang ng mga microorganism na natural na naroroon sa katawan.

Sa katunayan, kolonisado ito ng maraming iba't ibang fungi at bacteria, kadalasan ay hindi nakakapinsala at kahit na mahalaga para sa wastong paggana ng katawan.

Gayunpaman, maaaring mangyari na ang ilan sa mga fungi na ito ay dumami at nagiging pathogen, o ang isang "panlabas" na fungus, na ipinadala halimbawa ng isang hayop, ay nagdudulot ng impeksiyon. May kabuuang 200-400 species ng fungi ang maaaring magdulot ng sakit sa mga tao⁵.

Gayunpaman, ang mga fungi na naroroon sa kapaligiran ay maaari ring makahawa sa mga tao, halimbawa:

• sa pamamagitan ng inoculation, sa panahon ng isang pinsala halimbawa (na humahantong sa sporotrichosis o chromomycosis, atbp.);
• sa pamamagitan ng paglanghap ng mga hulma (histoplasmosis, apergillosis, atbp.);
• sa pamamagitan ng pakikipag-ugnay sa isang nahawaang tao (candidiasis, ringworm, atbp.);
• sa pamamagitan ng pakikipag-ugnay sa isang nahawaang hayop.